Qui-Gon Jinn est un Maître Jedi calme et sage mais qui possède la fâcheuse réputation d'avoir trop bon cur et de se fier un peu trop à son instinct.
A la suite de la demande du Conseil des Jedi de se rendre sur la planète Naboo afin de résoudre le conflit les opposants à la Fédération du Commerce, il va se retrouver sur Tatooine en compagnie de la Reine Amidala et de son apprenti Jedi, Obiwan Kenobi. Là-bas, il va faire la rencontre d'un jeune petit esclave, Anakin Skywalker, dont il est sûr qu'il est l'élu, .
Après avoir réussit à réparer le vaisseau de la Princesse et pu décamper de Tatooine, Qui-Gon se rend sur Coruscant afin de révéler le jeune Anakin au Conseil des Jedi, et réclamer de lui enseigner la formation de Jedi.
Mais, le Conseil refuse, jugeant le jeune enfant bien trop vieux pour débuter une formation. Vexé par la décision du Conseil, il décide tout de même de former le jeune Anakin, considérant son Padowan Obiwan apte à endosser le statut de Chevalier Jedi. Mais, au cours de la bataille de Naboo, Qui-Gon Jinn est tué par le redoutable Seigneur Noir des Sith, Dark Maul. Toutefois, avant de succomber à ses blessures, il parvient à demander à ObiWan la promesse de former Anakin (La menace fantôme).